Sala 2 del Duecento e di Giotto
Sala 3 del Trecento senese
Sala 4 del Trecento fiorentino
Sala 5-6 del Gotico internazionale
Sala 7 del primo Rinascimento
Sala 10-14 del Botticelli
Sala 16 delle carte geografiche
Sala 17 Stanzino delle Matematiche
Sala 19 del Perugino e di Signorelli
Sala 21 del Giambellino e di Giorgione
Sala 22 dei Fiamminghi e Tedeschi del Rinascimento
Sala 23 di Mantegna e di Correggio
sala 24 Gabinetto delle miniature
Sala 25 di Michelangelo e dei fiorentini
Sala 26 di Raffaello e di Andrea del Sarto
Sala 27 del Pontormo e del Rosso Fiorentino
Sala 28 di Tiziano e di Sebastiano del Piombo
Sala 29 del Dosso e del Parmigianino
Sala 30 Gabinetto degli Emiliani del Cinquecento
Sala 32 del Bassano e del Tintoretto
Sala 33 Corridoio del Cinquecento
Sala 34 dei Lombardi del Cinquecento
Sala 35 del Barocci e della Controriforma Toscana
Sala 43 del Seicento italiano ed europeo
Sala 44 di Rembrandt e dei Fiamminghi del Seicento
Sala 45 del Settecento italiano ed europeo
Ingresso al corridoio vasariano
Sala di Bartolomeo Manfredi
Sala di Gherardo delle Notti